非淋菌性尿道炎主要由沙眼衣原体、解脲脲原体等病原体感染引起，治疗常用的药物有大环内酯类、四环素类等。一般来说，规范使用药物大多能取得较好疗效。
常用药物类型
大环内酯类药物：
阿奇霉素： 是常用的大环内酯类药物之一，对沙眼衣原体等病原体有较好的抑制作用。通常单次口服一定剂量即可发挥疗效，但要注意对大环内酯类药物过敏者禁用。红霉素： 也属于大环内酯类，可用于非淋菌性尿道炎的治疗，不过胃肠道反应相对可能稍多一些，比如可能引起恶心、呕吐等不适，肝功能不全者要慎用。
四环素类药物：
多西环素： 对衣原体、支原体等有抑制作用。但是8岁以下儿童禁用，因为可能会影响牙齿和骨骼发育；孕妇也禁用，以免对胎儿造成不良影响。米诺环素： 同样属于四环素类，相对于其他四环素类药物，抗菌谱较广，不过也有一些禁忌，比如对四环素类药物过敏者不能用，而且服用后可能会出现头晕等不适症状，用药期间要避免驾驶或操作机械等。
特殊人群用药注意
孕妇群体：
孕妇患非淋菌性尿道炎时用药需格外谨慎，像四环素类药物是禁用的，因为可能会影响胎儿发育。一般会选择相对安全一些的药物，比如在医生评估后可能会选用大环内酯类中的某些药物，但也得密切监测孕妇和胎儿的情况。
儿童群体：
8岁以下儿童禁用四环素类药物，对于儿童非淋菌性尿道炎的治疗，会根据具体情况选择合适的药物，比如可能会选用大环内酯类药物，但要严格按照儿童的体重等情况在医生指导下使用，确保安全有效。
用药期间注意事项
在使用药物治疗非淋菌性尿道炎期间，要注意避免性生活，防止交叉感染。同时，要按照医生规定的疗程按时用药，不能自行随意停药，否则可能导致病情反复或者产生耐药性。而且用药后要注意观察自身症状是否有缓解，比如尿道分泌物是否减少、尿痛等症状是否减轻等，如果症状没有改善或者出现加重等情况，要及时复诊，调整治疗方案。