感染霉菌是否严重不能一概而论，一般来说，轻度的霉菌感染相对不严重，通过规范治疗多可好转，但如果是严重的、反复发作或累及重要脏器的霉菌感染则比较严重。
感染部位不同影响不同
皮肤霉菌感染：
浅表皮肤霉菌：像足癣（脚气）、体癣等，常见症状是瘙痒、脱皮等，通过外用抗真菌药膏，如克霉唑乳膏等，一般几周内可改善，相对不严重。指甲霉菌感染：甲癣治疗周期较长，可能需要数月，且容易复发，但及时治疗多数能控制病情，不算特别严重，但会影响外观和指甲功能。
黏膜霉菌感染：
口腔霉菌感染：鹅口疮多见于婴幼儿、免疫力低下者等，表现为口腔黏膜白色斑片，通过局部使用制霉菌素片涂抹等治疗，多数可治愈，一般不严重。阴道霉菌感染：霉菌性阴道炎很常见，主要症状是外阴瘙痒、白带呈豆腐渣样，规范用药后大多能缓解，不过容易复发，相对而言多数情况不算严重，但反复发作会影响生活质量。
深部霉菌感染：
肺部霉菌感染：严重的肺部霉菌感染，如侵袭性肺曲霉病等，常见于免疫力极度低下者，病情进展快，可能出现发热、咳嗽、呼吸困难等，治疗难度大，比较严重，预后可能不佳。中枢神经系统霉菌感染：如隐球菌性脑膜炎，病情凶险，可出现头痛、呕吐、意识障碍等，病死率较高，属于较严重的情况。
免疫力状况影响严重程度
免疫力正常者：单纯的局部轻度霉菌感染，通过外用药物等治疗，恢复较快，一般不影响整体健康状况，相对不严重。免疫力低下者：如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者等，霉菌感染容易扩散，病情进展迅速，而且难以控制，往往比较严重，可能危及生命。
治疗是否及时规范有关
及时规范治疗：轻度霉菌感染能在早期就得到正规治疗，如皮肤霉菌感染早期用合适药膏，很快能好转，不严重。治疗不及时或不规范：比如阴道霉菌感染拖延不治，可能会引起上行感染，导致盆腔炎等更严重的妇科疾病；肺部霉菌感染延误治疗，会发展成重症肺炎，加重病情，变得严重。