卵巢隐隐作痛可能由多种原因引起，比如生理性因素中，排卵期时部分女性可能会感觉卵巢部位有隐隐作痛，这种情况一般持续1 - 2天就会缓解。
生理性因素导致
排卵痛： 女性每个月会有一侧卵巢排卵，在排卵过程中，卵泡破裂以及卵泡液对腹膜的刺激可能会引起卵巢隐隐作痛，这种疼痛一般比较轻微，持续时间较短，多数在1 - 2天内自行缓解。月经期影响： 月经期间，盆腔处于充血状态，部分女性可能会感觉到卵巢部位有隐隐的不适，一般随着月经结束，症状会逐渐减轻。
病理性因素导致
妇科炎症
盆腔炎： 女性盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症时，可能会累及卵巢，引起卵巢隐隐作痛，同时还可能伴有下腹部坠胀、白带增多等症状。盆腔炎如果是慢性的，症状可能会反复发作。附件炎： 卵巢和输卵管统称为附件，附件发生炎症时，卵巢会受到影响出现隐隐作痛，常常表现为下腹部双侧或单侧的疼痛，可伴有发热、白带异常等情况。
卵巢囊肿
生理性囊肿： 如卵泡囊肿、黄体囊肿等，一般体积较小，多数可自行消失，部分人可能会感觉到卵巢隐隐作痛，通常在月经周期的特定阶段出现，随着囊肿的变化，疼痛可能会有改变。病理性囊肿： 如卵巢巧克力囊肿、浆液性囊腺瘤等，当囊肿增大到一定程度或者发生扭转、破裂等情况时，会引起卵巢隐隐作痛加剧，还可能伴有腹部包块等表现。
子宫内膜异位症
子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时称为子宫内膜异位症，当异位的内膜出现在卵巢部位时，会导致卵巢隐隐作痛，尤其在月经期间疼痛可能会加重，还可能影响生育功能，导致不孕等问题。