尿道口流脓且小便刺痛，需依据不同病因给予相应抗生素治疗。具体如下：
一、普通泌尿系感染：会出现尿频、尿急、尿痛以及尿道口有分泌物等情况。进行尿常规检查可见大量白细胞，泌尿系超声无异常。其治疗主要为抗感染，可实施经验性用药，或者依据尿培养结果来选择敏感抗生素予以治疗。
1.尿频：指排尿次数明显增多。
2.尿急：有急于排尿的强烈感觉。
3.尿痛：排尿时感觉疼痛。
二、淋菌性尿道炎：有不洁性行为史，伴有尿痛和尿道口流脓等表现。其分泌物量多且较稠厚，有时呈黄绿色，通过分泌物涂片可找到淋球菌。治疗以头孢菌素类抗生素为主。
1.不洁性行为史：指存在不卫生或不安全的性行为经历。
2.头孢菌素类抗生素：是一类常用的抗生素。
三、非淋菌性尿道炎：同样有不洁性行为史，也会有尿痛和尿道口分泌物等症状，不过分泌物量不多且较稀薄，经分泌物培养可发现衣原体和（或）支原体。治疗以大环内酯类抗生素为主。
1.大环内酯类抗生素：属于另一类重要的抗生素。
总之，当出现尿道口流脓、小便刺痛的情况时，要及时就医，明确病因后进行针对性治疗。