通常不存在“绍兴男性专科医院哪个最好”的绝对说法，患者应依据自身具体状况来挑选适宜的医院就医，在绍兴比较出色的男性专科医院包括绍兴市立医院、绍兴市上虞中医医院、绍兴第二医院。
一、绍兴市立医院：作为绍兴文理学院直属附属医院，即绍兴文理学院附属医院（绍兴市立医院）。其按三级甲等综合性医院的标准进行建设，是集医疗、科研、教学、预防与康复等功能于一体的医院，与绍兴市第一医疗集团（总院）实施一体化运行，和绍兴市人民医院执行一体化、同质化管理。医院所处环境依山傍水，优美宜人，学科设置全面，开设了急诊科（EICU）、重症监护室（ICU）、外科、内科、妇科、儿科、中医科、康复科、口腔科、体检中心等40个临床科室，还具有医学检验中心、放射影像中心、内镜中心、病理科、超声影像科、药剂科等8个医技科室以及4个研究所。
二、绍兴市上虞中医医院：这是一所汇聚医疗、教学、科研、保健和康复等功能的国家三级甲等中医医院。医院始建于1979年，于1996年迁址新建，在2018年正式成为浙江大学医学院附属邵逸夫医院绍兴院区。该医院是浙江大学医学院附属邵逸夫医院绍兴院区，也是浙江省中医院上虞分院、浙江省中山医院上虞分院，同时还是上海市第六人民医院合作医院、浙江省肿瘤医院合作医院，并且是浙江中医药大学、绍兴文理学院医学院、江西中医药大学的教学医院，荣获浙江省平安医院、浙江省绿色医院、绍兴市文明单位等称号。
三、绍兴第二医院：其始建于1910年，起初名为绍兴福康医院，当前是绍兴市建院历史颇为悠久的一家集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的三级乙等综合性医院，是浙大一院绍兴分院、绍兴文理学院附属第二医院以及全省10余所高等医学院校的教学医院。医院始终坚守“厚德求精，福康泽民”的办院理念，秉持“病人利益至上”的核心价值观，致力于建设一家能与百年老院历史地位相匹配、与绍兴经济社会发展水平相适应的现代化三级甲等医院以及人民满意医院。
总之，患者可自行选择合适的医院前往就诊。