发烧眼睛疼通常与以下原因有关，需明确后对症治疗。
一、眼内压增高：发烧若是因细菌感染引起，炎症不断复制会刺激眼睛，导致眼部房水流出障碍，进而引起眼内压增高，出现疼痛。对此需积极配合医生，使用阿莫西林胶囊、阿奇霉素片等药物进行抗炎治疗。
1.阿莫西林胶囊：是一种抗生素药物，能有效对抗细菌感染。
2.阿奇霉素片：对多种细菌有抑制和杀灭作用。
二、新型冠状病毒感染：部分感染新型冠状病毒的人，病毒会侵袭眼部，出现眼痛、眼痒、异物感、分泌物增多等眼部症状，同时侵袭体温中枢神经导致发烧，从而出现发烧眼睛疼。此时可遵医嘱选用阿昔洛韦滴眼液、利巴韦林滴眼液等改善病情。
1.阿昔洛韦滴眼液：主要用于对抗病毒感染引起的眼部问题。
2.利巴韦林滴眼液：对某些病毒有抑制作用。
三、结膜炎：结膜炎患者因炎症刺激也可能诱发发烧，并伴有眼睛疼痛、畏光、流泪、红肿等。可遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液等药物进行抗炎治疗。
1.妥布霉素滴眼液：能有效抑制炎症。
2.盐酸左氧氟沙星滴眼液：有较强的抗菌消炎效果。
除以上原因外，也可能是青光眼、高血压等疾病导致，具体需去医院详细检查以明确诊断。
总之，当出现发烧眼睛疼时，要综合各种症状和检查来准确判断原因，并采取针对性的治疗措施。