消化不良时可以使用一些药物来缓解症状，比如促胃肠动力药、助消化药等。一般来说，促胃肠动力药如多潘立酮等能在一定程度上改善消化不良情况。
促胃肠动力药
多潘立酮： 能促进胃肠蠕动，加快胃排空，通常可缓解因胃肠动力不足引起的消化不良，它主要是通过阻滞多巴胺受体，增强胃蠕动和食管下端括约肌张力。莫沙必利： 也是常用的促胃肠动力药，可促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道运动，改善消化不良相关症状，对全胃肠道均有促动力作用。
助消化药
乳酶生： 是一种传统的助消化药，为活肠球菌的干燥制剂，能在肠内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制腐败菌的生长繁殖，并防止肠内发酵，减少产气，因而有促进消化和止泻作用，适用于消化不良、腹胀及小儿饮食失调所引起的腹泻、绿便等。复方消化酶： 含有多种消化酶，如胃蛋白酶、胰蛋白酶、淀粉酶等，能促进食物的消化，用于食欲缺乏、消化不良，包括腹部不适、嗳气、早饱、餐后腹胀、恶心、排气过多、脂肪便等。
抑制胃酸分泌药
奥美拉唑： 属于质子泵抑制剂，能抑制胃酸分泌，对于因胃酸分泌过多导致消化不良的情况有缓解作用。它通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而发挥抑制胃酸的作用。兰索拉唑： 同样是质子泵抑制剂，作用机制与奥美拉唑类似，可有效抑制胃酸分泌，减轻胃酸过多对胃黏膜的刺激，改善消化不良伴随胃酸过多引起的胃痛、反酸等症状。
调节肠道菌群药
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌等肠道有益菌，能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善因肠道菌群失调引起的消化不良，比如可以缓解腹泻、便秘、腹胀等消化不良相关症状。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 以活菌进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样菌等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌有促进生长作用，从而可调整肠道菌群失调，改善消化功能。