三个月没来月经但没有怀孕，可能是以下原因导致的：
1.内分泌失调：如果长期精神压力过大、情绪波动明显或经常熬夜，可能导致内分泌失调，引起激素分泌异常，从而影响月经周期。此外，一些疾病也可能导致内分泌失调，如多囊卵巢综合征等。
2.多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，可能导致月经失调、多毛、痤疮、肥胖等症状。除了月经异常，还可能伴有胰岛素抵抗、高雄激素血症等问题。
3.其他因素：过度节食、剧烈运动、甲状腺功能减退等也可能导致月经推迟。
如果出现三个月没来月经的情况，建议及时就医，进行相关检查，如性激素六项、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
在就医前，不建议自行使用药物催经，因为药物的使用需要根据具体情况进行调整。如果是内分泌失调引起的月经不调，医生可能会建议调整生活方式、使用药物进行调理。如果是多囊卵巢综合征等疾病导致的，可能需要进行进一步的治疗。
此外，对于有性生活的女性，还需要排除怀孕的可能。如果自行检测结果为阳性，建议及时就医进行确诊。如果检测结果为阴性，但仍然担心怀孕，可以在医生的指导下进行进一步的检查。
总之，三个月没来月经但没有怀孕是一种异常情况，需要引起重视。及时就医，明确原因，并进行针对性的治疗，可以帮助恢复正常的月经周期。同时，保持良好的生活习惯和心态，对于月经的调节也非常重要。