HCG翻倍正常但孕酮低可通过使用黄体酮类药物治疗、注意饮食、注意休息、避免性生活以及出现问题及时就医等方式来处理。具体如下：
一、使用黄体酮类药物治疗：HCG翻倍正常但孕酮低，若是黄体功能低下引发，就应口服或注射黄体酮类药物，这样能减少子宫收缩，保证孕囊在子宫内安全生长。这是因为孕酮是由卵巢黄体分泌的一种天然孕激素，其在体内对雌激素激发过的子宫内膜有显著形态学影响，是维持妊娠的必需物质。而孕妇出现HCG翻倍正常但孕酮降低的状况往往是自身黄体功能不健全，导致生成的孕酮减少，此时补充黄体酮类物质能促进孕酮分泌，从而为胎儿早期生长发育提供有力保障。
二、注意饮食：多进食富含维生素、纤维素和蛋白质的食物，可增强体质并利于孕黄酮分泌。同时要严禁食用生冷、辛辣和活血的食物，以免子宫受到刺激。
此外，为确保胎儿正常生长，在怀孕期间还需注意按照相应流程进行产检，以便提前发现和解决胎儿问题；注意观察腹痛和阴道流血情况，有任何不适及时前往医院检查；注意孕期营养均衡，既不能暴饮暴食也不能营养不良；保持良好心情；适当进行运动；注意保暖；不吸烟、不饮酒；避免暴露在辐射下；用药必须咨询医生。
总之，HCG翻倍正常但孕酮低时，要综合采取多种措施来保障妊娠的顺利进行。