毛发红糠疹的病因目前尚未完全明确，可能与遗传因素、维生素缺乏、代谢障碍以及免疫系统异常等多种因素有关。其中遗传因素方面，有研究显示约20%的毛发红糠疹患者有家族遗传倾向；而维生素缺乏中，维生素A缺乏可能是一个相关因素，有调查发现部分毛发红糠疹患者存在维生素A水平偏低的情况。
遗传因素相关情况
遗传方式倾向：毛发红糠疹有一定的遗传易感性，其遗传方式可能为常染色体显性遗传。如果家族中有亲属患有毛发红糠疹，那么家族成员患病的风险相对会增加。基因关联情况：目前研究发现某些基因的突变可能与毛发红糠疹的发病相关，但具体的关联基因还在进一步探索中，不过已经确定遗传因素在其发病中占据一定比重。
维生素缺乏因素影响
维生素A缺乏关联：维生素A对于维持皮肤的正常角化等功能起着重要作用。当人体缺乏维生素A时，皮肤的角化过程可能会出现异常，从而增加患毛发红糠疹的风险。一般来说，正常成年人每天需要摄入一定量的维生素A来维持身体正常运转，而毛发红糠疹患者中部分存在维生素A摄入不足或吸收利用障碍的情况。其他维生素关联：除了维生素A，维生素B族等其他维生素的缺乏也可能对皮肤状态产生影响，虽然目前对于毛发红糠疹与其他维生素缺乏的具体关联研究还不是完全透彻，但整体维生素代谢异常在毛发红糠疹发病中是一个值得关注的方面。
代谢障碍因素方面
角质形成细胞代谢异常：毛发红糠疹患者存在角质形成细胞的代谢障碍，表现为角质形成细胞过度增殖和角化不全。正常情况下角质形成细胞的增殖和脱落是处于平衡状态的，但在毛发红糠疹患者中，这种平衡被打破，导致皮肤出现一系列异常表现，如红斑、鳞屑等。脂质代谢可能影响：有研究推测脂质代谢的异常也可能参与了毛发红糠疹的发病过程。脂质对于皮肤的屏障功能等有重要意义，脂质代谢异常可能会影响皮肤的正常结构和功能，进而引发毛发红糠疹相关的皮肤病变。
免疫系统异常因素
T细胞免疫失衡：免疫系统中的T细胞在毛发红糠疹的发病中可能起到重要作用。研究发现患者体内存在T细胞免疫失衡的情况，例如Th1和Th2细胞的平衡被打破，Th1细胞活性异常等，这种免疫失衡会导致皮肤的炎症反应和角质形成细胞的异常增殖，从而引发毛发红糠疹的症状。细胞因子参与：多种细胞因子也参与了毛发红糠疹的发病过程。例如肿瘤坏死因子 - α（TNF - α）等细胞因子水平的异常升高，会促进炎症反应的发生，加重皮肤的病变程度，导致毛发红糠疹的皮疹等表现更加明显。