自然流产后第二次月经一直不来，可能是以下原因导致：
1.子宫内膜损伤：自然流产可能会对子宫内膜造成一定的损伤，导致子宫内膜无法正常生长和脱落，从而引起月经推迟。
2.激素水平紊乱：自然流产后，体内激素水平可能会发生变化，导致月经失调。
3.宫腔粘连：如果自然流产过程中发生了子宫内膜炎或其他感染，可能会导致宫腔粘连，使月经无法正常排出。
4.再次怀孕：自然流产后，如果没有采取有效的避孕措施，可能会再次怀孕，导致月经不来。
针对这种情况，可以采取以下措施：
1.就医检查：如果月经推迟超过1周，应及时就医，进行B超、性激素六项等检查，以确定病因。
2.调整生活方式：保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适量运动等，有助于调节激素水平，促进月经恢复。
3.药物治疗：如果是激素水平紊乱导致的月经不来，可以在医生的指导下使用药物进行调节。
4.手术治疗：如果是宫腔粘连导致的月经不来，可能需要进行宫腔镜手术分离粘连。
需要注意的是，自然流产后月经恢复需要一定的时间，每个人的情况可能不同。如果月经推迟时间过长或伴有其他异常症状，应及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。同时，在自然流产后，应注意休息和保养，避免过早同房和再次怀孕，以减少对身体的伤害。