引起射精疼痛的原因主要包括器质性、功能性以及心理性这三个方面。
一、器质性：
1.这其中最为常见的是精道的炎症，例如附睾炎、前列腺炎、精囊炎、精阜炎、后尿道炎等，在射精时肌肉收缩便会引发疼痛。
2.后尿道结石、尿道狭窄导致排精受阻时也会引起疼痛，射精管出现结石梗阻以及先天性梗阻同样会造成射精疼痛。
二、功能性：
1.性交次数过于频繁、新婚时纵欲过度，特别是白天性交后，会出现会阴部或阴囊内的酸痛现象。
三、心理性：
1.部分男性可能因为自身性格存在缺陷，或是性生活不和谐，又或是工作压力、精神压力过大等因素，从而对射精产生焦虑及紧张情绪，进而诱发会阴部肌肉的痉挛性收缩，这属于心理因素导致的射精痛。
2.也有一些男性阴茎头部特别敏感，手触动龟头时会有疼痛感，这也和心理因素有一定关系。
3.还有部分男性由于神经官能症，可能会引起射精时的疼痛。
总之，射精疼痛的原因较为复杂，可能是以上一种或多种因素共同作用的结果，需要根据具体情况进行分析和诊断。