儿童肠胃炎用药需谨慎，一般可根据症状选择药物。如果是因病毒感染引起的肠胃炎，通常没有特效抗病毒药物，主要是对症治疗；若是细菌感染导致，可能会用到抗生素。比如，对于腹泻症状，可使用肠黏膜保护剂，像蒙脱石散，它能吸附肠道内的病菌和毒素，一般儿童可以使用，但要注意按照说明书的剂量来。
针对腹泻的药物
蒙脱石散：这是常用的肠黏膜保护剂，能在肠道表面形成一层保护膜，吸附病菌和毒素，帮助减轻腹泻症状。儿童可以服用，但要注意用适量温水冲服。消旋卡多曲：它能抑制肠道分泌，从而减少腹泻次数，适用于1月以上儿童的急性腹泻。
针对呕吐的药物
多潘立酮混悬液：可促进胃肠道蠕动，缓解呕吐症状，不过1岁以下婴儿慎用，需在医生指导下使用。维生素B6：也有止吐作用，对于因肠胃炎引起的呕吐，可适当使用，但也需遵循医生建议的剂量。
针对调节肠道菌群的药物
双歧杆菌四联活菌片：能调节肠道菌群平衡，抑制有害菌生长，有助于改善肠胃炎引起的肠道功能紊乱，儿童可以服用，但要注意用温水送服，且不宜与抗生素同时服用。枯草杆菌二联活菌颗粒：同样可以调节肠道菌群，维持肠道微生态平衡，适用于儿童肠胃炎导致的肠道菌群失调，服用时要用低于40℃的水冲服。
针对腹痛的药物
颠茄合剂：能缓解胃肠道痉挛引起的腹痛，但儿童使用需谨慎，要根据年龄和体重调整剂量，且不能长期大量使用。山莨菪碱片：也可缓解胃肠痉挛性疼痛，不过2岁以下儿童慎用，使用时需严格遵医嘱。