儿童肠胃炎用药需谨慎，一般可根据症状选择药物。如腹泻严重时，可使用蒙脱石散，它能吸附肠道内的病原体和毒素，起到止泻作用，通常儿童适用，但要注意按说明书或医嘱使用。
针对腹泻的药物
蒙脱石散：能在肠道形成保护膜，吸附病原体和毒素，帮助缓解儿童肠胃炎引起的腹泻症状。一般儿童可按剂量服用，但要注意正确冲调方法，避免影响药效。口服补液盐：儿童肠胃炎易出现脱水情况，口服补液盐可补充丢失的水分和电解质，预防和纠正脱水。要按比例冲调，少量多次给儿童服用。
针对腹痛的药物
颠茄片：有解除平滑肌痉挛的作用，能缓解儿童肠胃炎导致的腹痛，但2岁以下儿童需谨慎使用，因为其对儿童的影响还需更谨慎评估。山莨菪碱：也可用于缓解胃肠道痉挛引起的腹痛，不过同样要注意儿童的年龄限制，严格遵医嘱使用，避免不当使用对儿童造成不良影响。
针对感染的药物
益生菌：当儿童肠胃炎是由肠道菌群失调引起时，可使用益生菌，如双歧杆菌等。益生菌能调节肠道菌群，改善肠道功能，有助于肠胃炎的恢复，且相对较为安全，适合儿童使用，但要注意保存条件，保证其活性。抗生素：如果是细菌感染引起的肠胃炎，可能会用到抗生素，如头孢类抗生素等，但必须在医生明确诊断为细菌感染且有用药指征时才会使用，不能自行滥用，因为儿童使用抗生素需要严格把握适应证和剂量等。