第三代试管婴儿的成功率受到多种因素影响，一般来说，其整体成功率大约在40% - 60%左右，但具体到不同个体差异较大。
年龄因素影响
女性年龄是影响第三代试管婴儿成功率的重要因素。通常，年龄小于35岁的女性成功率相对较高，可能高于50%；而年龄大于38岁后，成功率会明显下降，可能不足40%。因为随着年龄增长，卵子质量和数量都会下降，进而影响胚胎着床和发育。
病因差异影响
不同的不孕病因也会对成功率产生影响。例如，因染色体异常导致的不孕，通过第三代试管婴儿技术可筛选出正常胚胎，这类患者如果其他条件合适，成功率可能相对有保障；而因输卵管堵塞等因素导致的不孕，经过治疗后结合第三代试管婴儿技术，成功率也会因个体具体情况有所不同。
胚胎质量影响
胚胎质量是关键。优质胚胎的成功率明显高于劣质胚胎。通过第三代试管婴儿技术对胚胎进行筛选，能提高优质胚胎的着床概率，但最终胚胎质量仍受多种内在因素决定，这也会影响整体成功率。
身体状况影响
女性自身的身体状况，如是否患有内分泌疾病、子宫内膜容受性等，都会影响第三代试管婴儿的成功率。例如，子宫内膜厚度适宜、容受性好的女性，胚胎着床成功率更高；而患有严重内分泌疾病的女性，可能需要先调整身体状况，否则会降低成功率。