扁桃体炎的治疗方法需根据病情来定。一般来说，急性扁桃体炎多由细菌感染引起，如A组乙型溶血性链球菌等，治疗上常用抗生素。
药物治疗
抗生素应用：对于细菌感染导致的扁桃体炎，青霉素类抗生素是常用选择，比如青霉素G，它能抑制细菌细胞壁合成，从而发挥杀菌作用。如果患者对青霉素过敏，可选用头孢菌素类抗生素，像头孢拉定等，这类药物对多种细菌有较好的抗菌活性。
局部治疗
含漱液使用：可以用复方硼砂溶液进行含漱，它能清洁口腔、杀菌消炎，有助于缓解扁桃体炎引起的咽部不适。一般每天含漱3 - 4次，每次含漱时间约1 - 2分钟。含片含服：西地碘含片也是常用的局部药物，它能在唾液作用下逐渐释放出碘，有杀菌抗感染的功效，含服时一般一次1片，一日3 - 5次。
一般治疗
休息与饮食：患者需要充分休息，一般建议休息2 - 3天，让身体有足够的能量来对抗炎症。同时要多喝水，每天饮水量应在1500 - 2000毫升左右，保持咽喉部湿润，还应进食清淡、易消化的食物，如米粥、面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，像辣椒、花椒等，以免加重咽部刺激。隔离防护：如果是传染性的扁桃体炎，比如由链球菌引起的具有一定传染性，患者要注意隔离，避免与他人密切接触，防止疾病传播。