阴茎根部皮肤有肉粒可能由多种原因引起，包括毛囊炎、疖肿、生殖器疱疹、尖锐湿疣、生殖器湿疹等。
一、毛囊炎、疖肿：
1.通常是因穿着不透气内裤，或是平时不注重卫生，以及食用辛辣刺激性食物等因素，致使阴茎部继发细菌感染。
2.局部会呈现红肿疼痛的丘疹，类似肉粒形态。处理时需清洁消毒后，涂抹莫匹罗星软膏或红霉素软膏等进行治疗。
二、生殖器疱疹：
1.由单纯疱疹病毒感染导致，可见阴茎根部皮肤有密集分布的肉粒样皮疹，同时可能伴有瘙痒。
2.确诊后可口服伐昔洛韦片，外用阿昔洛韦乳膏来进行医治。
三、尖锐湿疣：
1.倘若阴茎根部的肉粒呈菜花状或鸡冠状，且伴有瘙痒症状，那么很可能是由人乳头瘤病毒感染引发的尖锐湿疣。
2.需要前往医院皮肤科或性病科进行检查确诊。一般可通过激光手术去除疣体，之后涂抹抗病毒软膏进行治疗。
四、生殖器湿疹：
1.可能是阴茎根部与阴囊部位发生湿疹所致。
2.可看到局部有密集分布的丘疹，类似肉粒，会有明显的瘙痒感。这种情况需局部涂抹吡美莫司乳膏来进行治疗。
总之，当发现阴茎根部皮肤出现肉粒后，应及时前往医院皮肤科或性病科进行确诊，并依据具体病因展开积极的治疗。