新生儿巨细胞病毒感染的治疗需根据具体情况而定。一般来说，对于无症状的先天性巨细胞病毒感染婴儿，部分可能需要定期监测；而对于有症状的患儿则需积极干预。
抗病毒药物治疗
更昔洛韦：是治疗新生儿巨细胞病毒感染的常用抗病毒药物之一，它能抑制病毒DNA合成，从而发挥抗病毒作用。但使用更昔洛韦时需密切监测血常规等指标，因为它可能会引起骨髓抑制等不良反应。不过对于有明显症状的新生儿巨细胞病毒感染患儿，在医生评估受益大于风险时会考虑使用。
对症支持治疗
肝功能损害的处理：如果新生儿巨细胞病毒感染导致肝功能异常，可能需要使用保肝药物。比如可以使用还原性谷胱甘肽等药物来保护肝细胞，改善肝功能。同时要定期监测肝功能指标，观察治疗效果。听力损害的监测与干预：新生儿巨细胞病毒感染容易影响听力，需要定期进行听力筛查。如果发现听力异常，可能需要早期进行干预，如佩戴助听器等，以尽量减少对患儿听力发育的影响。
密切监测随访
生长发育监测：要定期监测感染新生儿的生长发育情况，包括体重、身高、头围等指标。因为巨细胞病毒感染可能会影响新生儿的生长，所以通过定期监测能及时发现生长发育异常并采取相应措施。神经系统发育评估：由于巨细胞病毒可能累及神经系统，需要定期进行神经系统发育评估，如通过神经行为评分等方式，了解新生儿神经系统的发育状况，以便早期发现可能出现的神经系统并发症并及时处理。