巧克力囊肿复发率通常指的是术后复发率，其复发率大概在20%到30%之间，甚至有的女性复发率可高达50%以上，不过具体复发几率在临床上并无确切数据，且与术后是否有辅助药物联合治疗存在关联，特别是手术未给予后续干预和护理时，复发几率会更大。巧克力囊肿主要是由于有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢上，可通过手术进行治疗，但术后很难将有活性的子宫内膜完全清除，所以存在复发可能。
一、术后治疗方式：
1.通常术后会使用促性腺激素释放激素拮抗剂，能抑制子宫内膜增生，从而降低复发率。如果术后采用药物联合治疗，复发率不高，可能在20%到30%左右。
2.若只是单纯进行手术，而没有术后的持续治疗，复发率则较高，可能会达到50%以上。
总之，巧克力囊肿术后复发率受多种因素影响，对于患者来说，术后应遵医嘱进行合理的治疗和护理，以降低复发风险。