宝宝喉咙长疱疹且反复发烧，很可能是手足口病或疱疹性咽峡炎导致的。具体如下：
一、手足口病：
1.这通常是由肠道病毒引起，宝宝会有喉咙出现疱疹、反复发烧的表现，还可能伴有咳嗽、流鼻涕、食欲不振等症状。
2.若宝宝体温超过38.5℃，可先采取温水擦浴、使用退热贴等物理降温方法，然后在医生指导下进行干扰素雾化治疗。因目前没有确切的抗病毒药物，所以一般不推荐使用抗病毒药物。
二、疱疹性咽峡炎：
1.常出现发热、咽痛、口痛、咽峡部疱疹等症状。
2.可通过退热贴或头部冷敷等方式进行物理降温，同时使用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物退热，要注意营养支持治疗，进食困难的需补液治疗。因其为自限性疾病，所以要注意增强免疫力。
在治疗期间，家长要注意给宝宝保暖，防止受凉加重病情。饮食上多让宝宝吃清淡食物，一定不能让宝宝喝生水，也不要吃辛辣、刺激、生冷的食物。
总之，当宝宝出现喉咙长疱疹且反复发烧的情况时，要明确是哪种疾病引起，然后采取针对性的治疗和护理措施，同时做好各方面的注意事项，以促进宝宝的恢复。