肝血管瘤形成原因目前尚不十分明确，一般认为可能与以下因素有关。首先是先天性发育异常，胚胎发育过程中，血管发育出现异常，导致血管内皮细胞异常增殖，从而形成肝血管瘤，有研究显示部分肝血管瘤患者从胚胎时期就存在血管发育的潜在问题。
先天发育因素：
血管发育异常： 在胚胎发育阶段，肝脏的血管形成过程中出现偏差，比如血管的内皮细胞过度增生，就可能逐渐形成肝血管瘤。这种先天性的血管发育异常是肝血管瘤形成的一个重要潜在因素，从胚胎时期就埋下了隐患。遗传易感性： 有一定的遗传倾向，如果家族中有肝血管瘤患者，那么其他家族成员患肝血管瘤的风险可能会相对增高。虽然具体的遗传机制还不完全清楚，但遗传因素在其中起到了一定作用。
激素影响：
女性激素相关： 女性患肝血管瘤的概率相对稍高一些，这可能与女性体内的激素水平有关。比如雌激素可能会对血管的生长产生一定影响，在女性的青春期、妊娠期等激素水平变化较大的时期，肝血管瘤可能更容易发生或生长加快。研究发现，女性在妊娠期时，肝血管瘤有增大的趋势，这与体内雌激素水平升高有一定关联。其他激素影响： 除了雌激素外，其他一些激素的失衡也可能对肝血管瘤的形成有一定作用，但具体机制还需进一步深入研究。
其他可能因素：
肝脏局部血管畸形： 肝脏局部的血管出现畸形，正常的血管结构被破坏，导致血管异常扩张形成瘤样结构，也就是肝血管瘤。这种局部血管畸形可能是由于后天的一些轻微损伤等因素诱发血管结构发生改变而形成。感染因素： 有研究推测，某些病毒感染可能与肝血管瘤的形成有关，但目前这方面的证据还不是非常确凿。不过有学者发现，在一些肝血管瘤组织中检测到了与病毒感染相关的物质，但还需要更多的研究来明确病毒感染究竟在肝血管瘤形成中起到怎样的具体作用。