疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹、溃疡为特征的疾病，治疗上主要是对症处理，一般没有特效的抗病毒药物。通常可以使用一些药物来缓解症状，比如布洛芬等退烧药，一般体温超过38.5℃时可以考虑使用。
对症治疗药物
退烧药：如果患者体温超过38.5℃，可以使用对乙酰氨基酚来退热，儿童可以选用儿童剂型的对乙酰氨基酚混悬液等。一般间隔4-6小时可以重复使用，24小时内不超过4次。缓解咽痛药物：可以使用含服的药物来缓解咽部疼痛，比如含有利多卡因成分的含漱液，能暂时减轻咽痛症状，但使用时要注意按照说明书或医嘱使用。
抗病毒药物相关情况
一般不推荐常规使用抗病毒药物：目前对于肠道病毒感染引起的疱疹性咽峡炎，并没有特效的抗病毒药物。因为肠道病毒感染属于自限性疾病，多数患者在1周左右能自行恢复。不过，对于一些重症患者或有特殊情况的患者，医生可能会根据情况评估是否使用抗病毒药物，比如对于手足口病合并疱疹性咽峡炎的重症患者，可能会考虑使用干扰素等，但这需要严格掌握适应证。
特殊人群用药注意
儿童用药：儿童患疱疹性咽峡炎时，使用药物需要格外谨慎。退烧药方面，2个月以上儿童可以使用对乙酰氨基酚，6个月以上儿童还可以选用布洛芬，但都要严格按照体重计算合适的剂量。在使用含服药物缓解咽痛时，儿童要在成人监护下使用，避免误服等情况。孕妇用药：孕妇患疱疹性咽峡炎时，用药更要慎重。退烧药一般优先选择对乙酰氨基酚，使用前要咨询医生，因为要考虑药物对胎儿的影响。缓解咽痛的药物也需要在医生评估后使用，确保母婴安全。