乳腺导管扩张的原因目前尚不十分明确，一般认为可能与以下几方面因素有关。首先，乳腺导管排泄障碍是常见原因之一，比如先天性乳头畸形、凹陷、不洁，或者炎症损伤导致导管狭窄、堵塞，使得导管内的分泌物排出不畅，从而淤积在导管内，刺激导管扩张。其次，激素水平异常也可能起到作用，女性体内的雌激素、孕激素等激素水平发生变化时，可能影响乳腺导管的正常生理功能，引发导管扩张。另外，感染因素也有一定关联，当乳腺导管受到细菌等病原体感染时，炎症反应可能导致导管结构和功能改变，进而出现扩张情况。
导管排泄障碍方面
先天性因素： 部分女性存在先天性的乳头、乳晕部位结构异常，像先天性乳头凹陷，这种情况发生率约为2% - 4%，由于乳头不能正常突出，就容易使导管开口堵塞，导致分泌物积聚，引发导管扩张。炎症损伤： 乳腺部位曾经有过炎症，比如乳腺炎，炎症愈合过程中可能形成瘢痕，造成导管狭窄，大约10% - 15%的乳腺导管扩张患者有过乳腺炎症病史，炎症损伤后瘢痕形成会影响导管通畅，导致导管扩张。
激素水平异常方面
青春期： 青春期女性体内激素开始波动，大约在12 - 18岁期间，激素水平的变化可能影响乳腺导管，有研究发现约5%的青春期女性可能出现短暂的乳腺导管轻度扩张情况，但大多可自行恢复。绝经期前后： 女性在绝经期前后，体内雌激素水平大幅波动，此时乳腺导管对激素变化较为敏感，约10% - 20%的绝经期前后女性会出现乳腺导管扩张相关症状。
感染因素方面
细菌感染： 当金黄色葡萄球菌等细菌侵入乳腺导管时，大约有3% - 5%的乳腺导管扩张患者能检测到乳腺导管内存在细菌感染，细菌感染引发炎症反应，使导管壁发生炎性改变，导致导管扩张。其他病原体感染： 除了细菌，病毒等其他病原体感染也可能参与其中，但相对细菌感染来说，比例较低，约1% - 2%的患者可能与病毒感染有关，病毒感染后引发的免疫反应会影响导管的正常结构和功能。