小孩屁眼疼可能由多种原因引起。比如，肠道寄生虫感染是常见原因之一，像蛲虫感染较为多见，夜间蛲虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，导致小孩屁眼疼，这种情况在儿童群体中并不罕见。
肠道寄生虫感染
蛲虫感染： 蛲虫通常在夜间活动，会爬出肛门产卵，从而刺激肛周皮肤，引起明显的瘙痒和疼痛，尤其在夜间小孩可能会因屁眼疼而睡不好觉。蛔虫等其他寄生虫： 蛔虫等肠道寄生虫感染也可能导致肠道功能紊乱，进而引发屁眼周围不适疼痛，但相对蛲虫感染来说，表现可能没那么典型。
局部皮肤问题
尿布疹： 如果小孩长时间使用尿布，且更换不及时，尿液和粪便刺激肛周皮肤，就容易引发尿布疹，出现屁眼疼的情况。特别是一些材质不透气的尿布，更易加重症状。肛周湿疹： 小孩肛周皮肤比较娇嫩，若受到潮湿、摩擦等因素影响，可能引发肛周湿疹，表现为肛周皮肤发红、瘙痒、疼痛等。
肛周局部损伤
外伤： 小孩活泼好动，肛周部位可能因意外碰撞、擦伤等导致局部损伤，引起屁眼疼。比如玩耍时不小心磕碰，或者搔抓过度导致皮肤破损。肛裂： 大便干结时，小孩排便困难，用力排便可能会撑裂肛管皮肤，造成肛裂，出现屁眼疼，同时可能伴有便血。
炎症感染
肛周炎： 不注意肛周清洁卫生，细菌等病原体容易滋生，引发肛周炎，导致屁眼周围红肿、疼痛。肠炎波及肛周： 小孩患有肠炎时，肠道炎症产生的分泌物等可能刺激肛周，引起屁眼疼，同时还可能伴有腹泻、腹痛等症状。