手足口病通常是由肠道病毒引起的，目前并没有特效的抗病毒药物能直接针对病毒进行杀灭。一般来说，手足口病是自限性疾病，大部分患儿1周左右即可自愈。但在患病期间，可根据症状使用一些药物来缓解不适。
针对发热的药物
体温监测与药物选择：当患儿体温超过38.5℃时，可考虑使用对乙酰氨基酚来退热。对乙酰氨基酚适用于3个月以上的儿童，能通过抑制前列腺素的合成发挥解热镇痛作用。需要注意的是，不要同时使用多种含有解热镇痛成分的药物，避免过量。
针对口腔疱疹的药物
局部用药缓解：如果患儿口腔有疱疹、疼痛明显，可使用康复新液等药物。康复新液可以促进黏膜修复，减轻口腔疱疹引起的疼痛。使用时可以用棉签蘸取少量康复新液涂抹在口腔疱疹处，但要注意使用方法和剂量，遵循医生的建议。
一般对症支持药物
补充水分与营养：由于手足口病患儿可能会因口腔疼痛而影响进食，所以要保证患儿充足的水分摄入，防止脱水。可以让患儿多喝温开水、果汁等。同时，要给予患儿清淡、易消化的饮食，保证营养供应，比如米粥、面条等，但要避免给患儿吃辛辣、刺激性食物，以免加重口腔不适。
特殊人群的注意事项
小年龄患儿需谨慎：对于3岁以下的婴幼儿，在使用药物时更要格外小心。因为他们的肝肾功能还未发育完全，药物代谢能力较弱。如果患儿出现精神差、持续高热不退、抽搐等症状，应及时就医，不要自行盲目用药，以免延误病情。