女性肚脐眼上面隐隐疼可能由多种原因引起。比如胃肠道方面的问题较为常见，像消化不良时就可能出现这种情况，一般可能会持续数小时到1 - 2天不等。
胃肠道疾病因素
胃炎： 多种因素可引发胃炎，如幽门螺杆菌感染等。胃炎患者除了肚脐眼上面隐隐疼，还可能伴有恶心、呕吐等症状。一般通过胃镜检查等可以辅助诊断。胃溃疡： 胃溃疡患者也常出现上腹部疼痛，疼痛具有一定规律性，比如进食后可能会有疼痛表现，还可能伴有反酸、嗳气等症状，胃镜检查能明确是否为胃溃疡以及溃疡的具体情况。
妇科疾病因素
盆腔炎： 女性盆腔内的器官发生炎症时，也可能导致肚脐眼上面隐隐疼。盆腔炎患者可能还会有下腹部坠胀、白带增多且异常等表现，通过妇科检查、B超等可以帮助诊断。附件炎： 附件包括输卵管和卵巢，附件发生炎症时，也可能引起上腹部附近的疼痛，同时可能伴有月经不调等症状，妇科检查等是辅助诊断的方法。
其他可能因素
胆囊疾病： 虽然胆囊在右上腹，但有时胆囊的病变也可能引起上腹部包括肚脐眼上面的牵涉痛。比如胆囊炎患者可能会有右上腹疼痛，疼痛可放射至右上腹及背部等部位，通过腹部B超等检查可了解胆囊情况。肠道寄生虫感染： 肠道内如果有寄生虫感染，也可能出现肚脐眼上面隐隐疼的情况，同时可能伴有消瘦、食欲不振等表现，通过粪便检查等可查找是否有寄生虫卵等情况来辅助诊断。