男性生殖系统感染的挂号科室主要有泌尿外科、感染科、皮肤科，具体应依据感染状况来确定。
一、皮肤科：当男性患者的生殖系统感染仅体现在生殖器表面时，例如因真菌感染引发的真菌性皮炎、湿疹等情况，就可以前往皮肤科就诊。
二、泌尿外科：若男性患者是尿道、膀胱、输尿管、前列腺等部位出现感染，那就需要到医院的泌尿外科进行诊治。
三、感染科：要是男性患者感染了梅毒、尖锐湿疣等传染性疾病，此时就必须到感染科接受治疗。
总之，男性生殖系统感染后要根据具体症状和感染类型来选择合适的科室进行挂号就诊，以便得到准确的诊断和恰当的治疗。