宝宝大便霉菌是指在大便检测中发现存在霉菌感染的状况。宝宝大便霉菌感染，如果是因为进食发霉食物引起，通常可以自愈；但若是因霉菌性肠炎导致，往往不能自愈。
一、若是因宝宝进食了发霉食物而致使霉菌在肠道内滋生，并吸附在大便上被排出体外，当宝宝停止进食发霉食物后，肠道内的霉菌可随着大便完全排出，进而达到自愈的效果。
二、但要是宝宝大便霉菌感染是由于滥用抗生素或激素类药物而引发霉菌性肠炎，这可能会让宝宝出现腹泻、腹痛、恶心呕吐、食欲不振等诸多不适症状，这种情况通常难以自愈，需要配合医生使用对症药物进行治疗，比如可使用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物来改善。在治疗期间，家长应注重宝宝的饮食，要以清淡、易消化的食物为主。
总之，宝宝大便霉菌感染的原因不同，其是否能自愈以及治疗方式也不同，需要根据具体情况来判断和处理。