宝宝大便霉菌能否自愈以及需要采取的措施如下：
1.能否自愈：宝宝大便霉菌可能是由真菌感染引起的，如白色念珠菌感染。一般情况下，轻度的霉菌感染可能会在宝宝自身免疫力的作用下逐渐自愈。然而，对于严重的霉菌感染或宝宝免疫力较弱的情况，自愈的可能性较小，需要及时治疗。
2.治疗措施：
就医诊断：如果宝宝大便中发现霉菌，应及时带宝宝就医，进行详细的检查和诊断，以确定感染的具体原因和严重程度。
药物治疗：医生可能会根据宝宝的情况开具抗真菌药物，如克霉唑、酮康唑等。这些药物通常需要在医生的指导下使用，按照正确的剂量和疗程进行治疗。
调整饮食：在治疗期间，需要注意宝宝的饮食调整。可以给宝宝提供易消化、富含营养的食物，避免食用过于油腻、刺激性或难以消化的食物。
注意卫生：保持宝宝的口腔、皮肤和尿布区域的清洁卫生，经常更换尿布，避免过度使用抗生素等。
密切观察：密切观察宝宝的症状变化，如大便情况、食欲、精神状态等。如果症状没有改善或加重，应及时复诊。
需要注意的是，宝宝的身体较为娇嫩，对于药物的耐受性和反应可能与成人不同。因此，在给宝宝使用任何药物之前，都应先咨询医生的意见，并严格按照医生的建议使用药物。同时，保持宝宝的生活环境清洁卫生，增强宝宝的免疫力，有助于预防霉菌感染的发生。如果对宝宝的健康状况有任何疑虑，最好及时咨询专业的医生。