女性生殖器疱疹主要通过抗病毒药物来治疗，常用的抗病毒药物有阿昔洛韦等，一般通过规范用药可有效控制病情。
抗病毒药物选择
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰疱疹病毒DNA合成，起到抑制病毒复制的作用。可口服给药，对于初发的女性生殖器疱疹，一般能在一定程度上缓解症状、缩短病程。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，服用后在体内能迅速转化为阿昔洛韦发挥作用，疗效与阿昔洛韦相当，但服用次数相对较少，患者依从性可能更好。
局部治疗方法
外用洗剂： 可以使用3%硼酸溶液进行湿敷，能起到清洁、收敛的作用，有助于减轻局部的红肿、渗出等症状。比如患者局部有较多渗出时，用3%硼酸溶液浸湿纱布后敷在患处，每次敷15 - 20分钟，每天可敷数次。外用药膏： 阿昔洛韦乳膏也是常用的外用药物，直接涂抹在患处，能对局部的疱疹病毒起到抑制作用，促进疱疹的干涸、结痂。一般每天涂抹数次，按需使用。
生活注意事项
休息与饮食： 患病期间要注意休息，保证充足的睡眠，避免过度劳累，因为身体免疫力下降可能会导致病情加重或复发。在饮食上要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，同时要戒烟戒酒，多吃富含维生素和蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果、牛奶、鸡蛋等，有助于增强身体抵抗力。避免性行为： 在生殖器疱疹发作期，一定要避免性行为，因为此时病毒传染性较强，容易将病毒传染给性伴侣。即使在病情缓解期，也建议使用安全套进行防护，降低传染风险。