女性生殖器疱疹主要由单纯疱疹病毒（HSV）引起，治疗上常用抗病毒药物来缓解症状、缩短病程等。一般来说，阿昔洛韦等抗病毒药物是常用的治疗药物。
常用抗病毒药物
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰病毒DNA合成，抑制病毒复制。可口服，也能外用软膏。口服的话，能减轻生殖器疱疹的症状和缩短病程。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，服用次数相对较少，疗效与阿昔洛韦相当，能有效减轻生殖器疱疹的临床症状和体征。
治疗中的一般护理要点
保持局部清洁： 要每天用清水清洗患处，保持局部的清洁干燥，防止继发细菌感染。清洗时动作要轻柔，避免摩擦患处，加重损伤。避免搔抓： 生殖器疱疹患处可能会有瘙痒感，但一定要避免用手搔抓，因为搔抓可能会导致水疱破裂，引起感染扩散，还可能会使病情加重，延长病程。
特殊人群的注意事项
孕妇患者： 孕妇感染生殖器疱疹需要特别谨慎用药。阿昔洛韦在孕妇中的使用属于B类药物，即在动物实验中未显示致畸，但在人类研究缺乏足够数据，使用时需权衡利弊。如果病情需要，医生会根据孕妇的具体情况来决定是否使用及使用方案。哺乳期患者： 哺乳期女性使用抗病毒药物时也需要考虑药物对婴儿的影响。例如阿昔洛韦可分泌至乳汁，虽然乳汁中的浓度很低，但哺乳期女性使用时应停止哺乳，待停药后再恢复哺乳，以避免药物通过乳汁影响婴儿。
预防复发相关
增强免疫力： 日常生活中要注意加强锻炼，比如每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动，像快走、慢跑等，也可以结合力量训练，以增强身体的免疫力，有助于减少生殖器疱疹的复发。同时，要保证充足的睡眠，每天尽量保证7 - 8小时的睡眠时间，让身体得到充分的休息。避免诱因： 要注意避免一些诱发因素，比如过度劳累、精神紧张、发热等。当身体处于疲劳状态或精神压力大时，免疫力会下降，容易导致生殖器疱疹复发。所以要保持良好的生活作息和心态，尽量减少这些诱因的影响。