唇腭裂的发生是多种因素综合作用的结果。据研究，大约有2% - 3%的新生儿会出现唇腭裂情况。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有唇腭裂，那么后代发生唇腭裂的风险会增加。有数据显示，若一级亲属（父母、子女以及兄弟姐妹）中有唇腭裂患者，子代发病风险比普通人群高约3 - 4倍。基因变异作用： 一些特定基因的变异可能与唇腭裂的发生相关。例如，MSX1、IRF6等基因的突变或异常表达，会影响胚胎时期面部发育相关组织的正常分化和融合，从而导致唇腭裂出现。
母体孕期环境因素
营养缺乏影响： 孕期母体缺乏某些重要营养物质，比如叶酸。孕妇在怀孕早期如果叶酸摄入不足，会干扰胚胎面部发育过程中的细胞分裂和组织形成，使唇腭裂发生几率升高。一般建议孕妇在孕前3个月至孕早期3个月每天补充0.4 - 0.8毫克叶酸。药物影响： 孕期不合理使用某些药物也可能引发唇腭裂。像一些抗癫痫药物，若孕妇在不知情的情况下服用了这类药物，可能会通过胎盘影响胎儿面部发育，增加唇腭裂风险。感染因素： 孕期母体感染某些病毒，如风疹病毒。孕妇在怀孕早期感染风疹病毒，病毒可通过胎盘侵袭胎儿，影响面部发育相关结构的正常形成，导致唇腭裂发生。
其他环境因素
吸烟饮酒影响： 孕妇在孕期吸烟或饮酒，会对胎儿发育产生不良影响。吸烟产生的尼古丁等有害物质以及饮酒摄入的酒精，会干扰胚胎的正常生长发育，增加胎儿出现唇腭裂的可能性。研究表明，孕妇吸烟的话，胎儿患唇腭裂的风险比不吸烟孕妇高约2 - 3倍。辐射暴露： 孕期长时间接触高剂量的辐射，例如在放射科工作且防护不当，或者频繁接受X线检查等，辐射可能会损伤胚胎细胞，影响面部发育相关组织的形成，进而导致唇腭裂发生。