怀孕36周出现大腿根部内侧疼痛，可能涉及以下几种情况：一是耻骨联合分离，二是坐骨神经受压，三是孕期补钙不足导致缺钙，四是下肢血栓形成，五是髋关节病变。
一、耻骨联合分离：若胎头过大可能引发耻骨联合分离，进而导致大腿根部内侧疼痛。同时孕晚期孕妇坐骨神经长期受压，也可能使大腿根部内侧出现一定程度疼痛。这属于正常生理反应，通常无需特殊处理，多注意休息即可。产后可通过X线平片检查、B超检查来确诊，治疗方法包括手法复位、产后康复治疗、骨盆固定带固定等，一般预后良好。
二、缺钙：孕期一般从中期开始补钙，如果孕妇补钙不足，可能会出现肌肉痉挛，从而引起怀孕36周时大腿根部内侧疼痛。孕期要注意补充钙片，可通过晒太阳促进钙吸收，饮食上可多食用奶等含钙量多的食物，但要注意营养均衡，避免能量摄入过多导致体重增加过快，增加妊娠期糖尿病的风险。
三、下肢血栓：当下肢有血栓形成时，患侧肢体通常比对侧肢体肿胀明显，也会表现为大腿根部内侧疼痛，通过下肢血管超声检查可发现，这种情况相对较少见。孕产妇处于高凝状态，容易形成血栓，所以要注意适当活动以预防下肢静脉血栓形成。若已形成血栓，因孕妇处于孕晚期，需在医生指导下进行相应处理，可能会采用低分子肝素钠皮下注射的方法进行治疗。
四、髋关节疾病：若排除上述疾病，需及时到骨外科就诊，排除有无髋关节疾病。如有情况要尽早就诊，做到早发现早诊治。例如确诊为髋关节炎，由于炎症疼痛放射至大腿根部内侧而出现疼痛，可在医生指导下口服氨基葡萄糖缓解症状。
总之，怀孕36周大腿根部内侧疼痛可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行诊断和处理。