慢性肺呼吸衰竭最常见的病因是慢性阻塞性肺疾病（COPD），据统计，约有80%左右的慢性肺呼吸衰竭是由COPD引发的。
慢性阻塞性肺疾病相关情况
气道病变方面： 长期的吸烟是导致COPD的重要因素，吸烟时间越长、吸烟量越大，患COPD进而引发慢性肺呼吸衰竭的风险就越高。例如，每天吸烟20支以上，连续吸烟超过20年的人，比不吸烟人群患COPD的几率要高很多倍。气道会出现慢性炎症，使得气道狭窄，通气功能受到影响。肺实质病变方面： 肺部的终末细支气管远端气腔会出现异常持久的扩张，并且伴有肺泡壁和细支气管的破坏，而没有明显的纤维化。这会大大降低肺的气体交换能力，导致氧气吸入不足和二氧化碳排出障碍，从而引发慢性肺呼吸衰竭。
胸廓运动障碍性疾病相关情况
脊柱畸形： 严重的脊柱侧凸、后凸等脊柱畸形会影响胸廓的正常形态和运动，使得胸廓的扩张受限，肺的通气功能受到阻碍。比如一些先天性的严重脊柱畸形患儿，随着年龄增长，很容易逐渐发展为慢性肺呼吸衰竭。神经肌肉疾病： 像脊髓灰质炎、多发性神经炎等神经肌肉疾病会影响呼吸肌的功能。呼吸肌无力或麻痹会导致呼吸动力不足，无法有效进行呼吸运动，进而影响气体交换，引发慢性肺呼吸衰竭。例如脊髓灰质炎患者，如果病情影响到呼吸相关的神经和肌肉，就可能逐步出现呼吸功能不全，最终发展为慢性肺呼吸衰竭。
肺血管疾病相关情况
慢性血栓栓塞性肺动脉高压： 反复发生的肺小动脉栓塞及血栓形成，会导致肺动脉高压。长期的肺动脉高压会增加右心的负担，影响肺的血液循环和气体交换，最终可能引发慢性肺呼吸衰竭。研究发现，有过肺栓塞病史的患者，如果没有得到有效控制，约有一定比例会逐渐发展为慢性肺呼吸衰竭。其他肺血管病变： 如累及肺动脉的过敏性肉芽肿病等，也会影响肺血管的正常功能，导致肺的气体交换受到影响，进而引发慢性肺呼吸衰竭。这类疾病相对较为少见，但同样会对肺呼吸功能产生不良影响。