慢性呼吸衰竭是各种原因引起的肺通气和（或）换气功能严重障碍，以致在静息状态下亦不能维持足够的气体交换，导致低氧血症伴（或不伴）高碳酸血症，进而引起一系列病理生理改变和相应临床表现的综合征。其常见病因主要有以下几类：
一、气道病变导致
支气管-肺疾病： 慢性阻塞性肺疾病是导致慢性呼吸衰竭最常见的病因之一，约占所有病因的80%左右。它是一种具有气流受限特征的肺部疾病，持续存在的气流受限进行性发展，与气道和肺组织对香烟烟雾等有害气体或颗粒的慢性炎症反应增强有关。另外，重症支气管哮喘也可能发展为慢性呼吸衰竭，在哮喘急性发作未得到有效控制时，会出现严重的通气功能障碍。
二、肺组织病变引发
肺部感染性疾病： 严重的肺部感染，如重症肺炎，当肺部广泛的肺组织被炎症浸润，影响气体交换功能时，就可能导致慢性呼吸衰竭。例如，老年人、儿童等免疫力低下人群发生重症肺炎后，更易出现呼吸功能的严重损害。间质性肺疾病： 特发性肺纤维化是常见的间质性肺疾病，它会使肺间质逐渐纤维化，肺的弹性降低，气体交换面积减少，影响氧气的吸入和二氧化碳的排出，进而引发慢性呼吸衰竭。患者会逐渐出现进行性加重的呼吸困难等症状。
三、胸廓与胸膜病变所致
胸廓畸形： 严重的胸廓畸形，如严重的脊柱侧凸，会影响胸廓的正常活动，限制肺部的扩张，导致通气功能障碍。这类患者往往从青少年时期就可能出现胸廓发育异常，随着年龄增长，呼吸功能逐渐受到影响，进而发展为慢性呼吸衰竭。胸膜病变： 广泛的胸膜增厚、粘连会限制肺的扩张，影响肺的通气和换气功能。例如，结核性胸膜炎治愈后可能遗留广泛胸膜增厚，长期下来会导致慢性呼吸衰竭。
四、神经肌肉病变引起
神经肌肉疾病： 脊髓侧索硬化症会影响支配呼吸肌的神经功能，导致呼吸肌无力。患者的呼吸肌无法正常收缩和舒张，影响肺的通气功能。重症肌无力也可能累及呼吸肌，当病情逐渐进展时，会出现呼吸肌无力，导致慢性呼吸衰竭。患者可能表现为眼睑下垂、肢体无力，逐渐发展到呼吸肌受累，出现呼吸困难等症状。