跑步后膝盖内侧痛，是否会自愈，取决于多种因素，以下是一些可能的情况：
1.轻度损伤：如果膝盖内侧痛是由于轻微的扭伤、劳损或过度使用引起的，例如跑步时姿势不正确或跑步强度过大，这种情况下，休息、冷敷、适当的物理治疗和避免进一步的损伤通常可以促进自愈。可能需要几天到几周的时间来缓解疼痛。
2.结构性问题：然而，如果膝盖内侧痛是由于结构性问题引起的，如半月板损伤、韧带损伤或其他骨骼问题，自愈的时间可能会更长，甚至可能需要手术治疗。这些问题需要专业医生的评估和适当的治疗方案。
3.其他健康问题：某些健康问题，如关节炎、滑膜炎或其他炎症性疾病，也可能导致膝盖内侧痛。在这些情况下，自愈的可能性较小，可能需要长期的治疗和管理。
4.个人因素：个体的差异也会影响自愈的时间。一些人可能恢复得更快，而另一些人可能需要更长的时间来缓解疼痛。年龄、身体健康状况、运动能力和治疗的及时性等因素都可能起作用。
在大多数情况下，以下步骤可以帮助加速恢复和减轻疼痛：
1.休息：停止跑步或其他导致疼痛的活动，给膝盖足够的休息时间。
2.冰敷：在疼痛的部位用冰袋冷敷，每次15-20分钟，每天数次，有助于减轻肿胀和疼痛。
3.物理治疗：可以包括按摩、拉伸、电疗等物理治疗方法，以帮助缓解疼痛和恢复功能。
4.适当的运动：在医生或物理治疗师的指导下，进行适当的康复运动，加强膝盖周围的肌肉，改善关节的稳定性。
5.药物治疗：可以使用止痛药、消炎药或其他医生建议的药物来缓解疼痛和减轻炎症。
6.寻求专业帮助：如果疼痛持续不缓解、加重或出现其他症状，如肿胀、无法伸直或行走困难，应及时咨询医生或物理治疗师。他们可以进行详细的评估，制定个性化的治疗计划，并提供进一步的建议。
需要注意的是，自我判断和处理疼痛是有限的，对于长期或严重的膝盖疼痛，专业的医疗建议是至关重要的。医生可能会进行进一步的检查，如X光、磁共振成像（MRI）等，以确定具体的问题，并制定最适合的治疗方案。
此外，预防是关键。在跑步或进行其他运动前，进行适当的热身和拉伸，保持正确的跑步姿势，逐渐增加运动强度，以及穿戴合适的运动装备，都可以减少膝盖受伤的风险。
总之，跑步后膝盖内侧痛是否会自愈因人而异。如果疼痛持续或加重，最好咨询医生以获得准确的诊断和治疗建议。及时采取适当的措施，可以促进恢复并减少潜在的长期问题。