总是口腔溃疡可能由多种原因造成。一般来说，复发性阿弗他溃疡的发生率较高，人群中约10% - 25%的人会受到其困扰。
一、局部因素
创伤性因素： 口腔内有残根、残冠或者不合适的假牙等，会反复摩擦口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。比如长期存在的锐利牙尖，就可能持续刺激口腔黏膜，导致溃疡长时间不愈。感染因素： 病毒感染是常见原因之一，像单纯疱疹病毒感染，就容易引起口腔溃疡。当人体免疫力下降时，潜伏在体内的病毒就会活跃起来，引发口腔黏膜的炎症反应，出现溃疡。
二、全身因素
营养缺乏： 缺乏维生素B族、维生素C等营养物质时，容易出现口腔溃疡。例如，长期吃素的人，如果膳食搭配不合理，很可能缺乏维生素B2，进而增加口腔溃疡的发生几率。铁、锌等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关，当体内锌元素含量较低时，会影响细胞的正常代谢，导致口腔黏膜修复功能受影响，引发溃疡。免疫系统异常： 自身免疫性疾病患者，如白塞病患者，口腔溃疡是常见症状之一。这类患者的免疫系统会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，导致溃疡反复发作，而且溃疡可能比较严重，愈合时间也较长。另外，免疫力低下的人群，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病的人，更容易受到各种病原体的侵袭，从而出现口腔溃疡。
三、其他因素
精神因素： 长期精神紧张、焦虑、压力过大等，会影响人体的神经调节和内分泌功能，进而诱发口腔溃疡。比如考试前的学生、工作压力大的上班族，由于精神长期处于紧张状态，口腔溃疡的发生率会有所升高。遗传因素： 如果家族中有复发性口腔溃疡的遗传倾向，那么个体患病的几率可能会增加。研究发现，某些基因的突变与复发性口腔溃疡的易感性相关，有家族史的人相对更容易总是出现口腔溃疡。