儿童淋巴结肿大的原因有多种。一般来说，感染是导致儿童淋巴结肿大较常见的原因，比如上呼吸道感染时，大约有60% - 70%的儿童会出现颈部淋巴结肿大，这是因为病毒或细菌入侵人体，刺激淋巴结反应性增生。
感染性因素导致
病毒感染： 像EB病毒感染，会引起传染性单核细胞增多症，除了淋巴结肿大，还可能有发热、咽峡炎、肝脾肿大等表现。另外，风疹病毒感染也会造成淋巴结肿大，通常在出疹前1 - 2天颈部淋巴结就开始肿大，然后蔓延至其他部位。细菌感染： 化脓性扁桃体炎可能引发颈部淋巴结肿大，这是因为细菌感染扁桃体后，炎症蔓延到周边淋巴结。还有猩红热，是由A组乙型溶血性链球菌引起的急性呼吸道传染病，也会出现淋巴结肿大，多为颈部、颌下淋巴结肿大。
非感染性因素导致
免疫性疾病： 幼年特发性关节炎，这是儿童时期常见的风湿性疾病，除了关节症状，还可能伴有淋巴结肿大，一般是全身淋巴结轻至中度肿大。还有系统性红斑狼疮，虽然在儿童中相对少见，但也可能出现淋巴结肿大的情况，同时会有面部红斑、口腔溃疡、脱发等多系统受累表现。肿瘤性因素： 白血病是儿童时期常见的恶性肿瘤，其中急性淋巴细胞白血病较为多见，会出现全身淋巴结肿大，质地较硬，可活动或融合。还有淋巴瘤，分为霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤，儿童也可能患病，表现为无痛性进行性淋巴结肿大，可伴有发热、消瘦等症状。