在月经第二天进行性行为并内射，一般不会导致怀孕。但需要注意的是，以下情况也可能出现：
1.经期感染：月经期间，女性的子宫颈口张开，子宫内膜脱落，此时进行性行为，容易将细菌带入子宫，引起感染。此外，性行为时的刺激也可能导致月经量增多、经期延长。如果出现发热、腹痛、白带异常等症状，应及时就医。
2.子宫内膜异位症：经期同房，还可能导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在盆腔其他部位，引起子宫内膜异位症。这可能导致痛经、性交痛、月经失调等症状，严重时可能影响生育。
3.免疫性不孕：如果女性对精液或经血中的某些成分产生抗体，可能会影响受孕。但这种情况比较罕见。
需要注意的是，每个人的身体状况不同，以上情况并非一定会发生。为了女性的健康，建议在经期避免同房。如果出现异常症状，应及时就医。此外，如果没有怀孕计划，无论在经期还是其他时间，都应采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。