汉坦病毒主要通过三种途径传播。首先是动物源性传播，啮齿类动物是主要传染源，比如鼠类感染汉坦病毒后，病毒会存在于它们的唾液、尿液、粪便中。当人们接触到被鼠类分泌物污染的环境，像尘土飞扬时，带有病毒的尘埃可能通过呼吸道进入人体引发感染。其次是接触传播，被感染鼠类咬伤或者破损的皮肤、黏膜接触到鼠类的排泄物等，病毒就有可能通过这些途径侵入人体。另外，还有经消化道传播，食用了被鼠类排泄物污染的食物，病毒会随着食物进入消化道从而感染人体。
动物源性传播方面
鼠类携带病毒： 已知有50多种啮齿动物可自然感染汉坦病毒，其中褐家鼠、黑线姬鼠等是我国主要的汉坦病毒宿主动物。环境接触风险： 在一些老旧房屋、仓库等鼠类容易出没的地方，如果长期不进行卫生清理，鼠类的排泄物大量存在，人们进入这样的环境就增加了感染风险，尤其是在打扫卫生时扬起灰尘，更易让病毒通过呼吸道进入人体。
接触传播方面
咬伤感染情况： 要是被感染汉坦病毒的鼠类咬伤，病毒很容易通过伤口直接进入人体血液循环。黏膜接触风险： 比如眼睛、口腔等黏膜部位接触到鼠类的排泄物，像不小心用手触摸了鼠类排泄物后又揉眼睛，病毒就可能通过黏膜侵入人体。
经消化道传播方面
食物污染情况： 当鼠类在粮食、蔬菜等食物上排泄，而这些食物没有经过彻底清洗和烹饪就被食用，病毒就会随着食物进入消化道。例如，在一些储存粮食的地方，鼠类频繁活动，粮食被鼠尿等污染后，如果直接做成食物食用，就有感染风险。