过敏性鼻炎与鼻窦炎在发病部位、症状表现和发病原因上都有区别。过敏性鼻炎是鼻腔黏膜的变态反应性疾病，而鼻窦炎是鼻窦黏膜的炎症。一般来说，过敏性鼻炎的发病率较高，在人群中约有10%-20%的人患有过敏性鼻炎。
发病部位：
过敏性鼻炎： 主要发病部位是鼻腔黏膜。鼻腔黏膜接触过敏原后发生免疫反应。鼻窦炎： 发病部位是鼻窦，包括上颌窦、筛窦、额窦和蝶窦等鼻窦的黏膜。
症状表现：
过敏性鼻炎： 典型症状是阵发性喷嚏，一般每次多于3个，甚至可达十几个；大量清水样鼻涕，每天可擤出几大杯；鼻痒，患者常感觉鼻腔内瘙痒难忍；鼻塞，轻重程度不一。另外，还可能伴有眼痒、流泪等眼部症状。鼻窦炎： 全身症状可能有发热、畏寒、食欲减退、便秘等，儿童可能表现更明显。局部症状有鼻塞，多为持续性，因鼻黏膜充血肿胀和分泌物积存所致；脓涕，鼻涕多为脓性或黏脓性，量多少不定；头痛，不同鼻窦引发的头痛有一定规律，比如额窦炎一般晨起头痛，逐渐加重，午后减轻；上颌窦炎则是晨起轻，午后重。
发病原因：
过敏性鼻炎： 主要是接触过敏原引起，常见过敏原包括吸入性过敏原如花粉（不同季节有相应花粉过敏原，像春季的树花粉、秋季的草花粉等）、尘螨、动物皮屑等；食物性过敏原如牛奶、鸡蛋、鱼虾等。鼻窦炎： 多是由于鼻腔疾病引起，比如急性鼻炎可引起鼻窦炎，鼻腔的息肉、肿瘤等阻塞鼻窦开口，导致鼻窦引流不畅从而引发鼻窦炎；邻近器官的感染也可能波及鼻窦，如扁桃体炎、腺样体炎等；还有外伤因素，鼻窦骨折或异物进入鼻窦也可能引发鼻窦炎。