扁平疣的治疗方法如下：
1.物理治疗：
冷冻治疗：利用低温作用于疣体，使组织坏死脱落。
激光治疗：通过激光的高温作用破坏疣体。
电灼治疗：利用电流产生的高温破坏疣体。
2.外用药物治疗：
维A酸乳膏：调节表皮角质形成细胞的分化，促使扁平疣消退。
咪喹莫特乳膏：具有免疫调节作用，可抑制扁平疣的生长。
酞丁安乳膏：抗病毒药物，可抑制扁平疣病毒的复制。
3.系统药物治疗：
干扰素：具有抗病毒、免疫调节作用，可用于扁平疣的治疗。
左旋咪唑：可调节免疫功能，有助于扁平疣的消退。
4.中医治疗：
中药口服：根据个体情况辨证论治，选用清热解毒、活血化瘀等中药。
中药外用：可使用中药煎剂浸泡或湿敷疣体。
需要注意的是，扁平疣具有传染性，治疗期间应避免搔抓疣体，以免扩散。同时，要保持皮肤清洁，避免感染。在治疗过程中，如果疣体持续不愈或出现加重，应及时就医，调整治疗方案。此外，部分患者在治疗后可能会复发，需要定期复诊。以上治疗方法应在医生的指导下进行，根据个体情况选择合适的治疗方案。