耳后跳着疼可能由多种原因引起，比如神经痛，像三叉神经痛发作时就可能牵扯到耳后出现跳痛，这种情况有时可能突然发作，疼痛较为剧烈。
一、神经因素导致
枕大神经痛： 枕大神经分布区域包括耳后部位，当枕大神经受到刺激或发生炎症时，就可能出现耳后跳着疼的情况。比如长时间低头、颈部外伤等因素都可能诱发枕大神经痛，疼痛性质多为刺痛、跳痛。面神经受刺激： 面神经经过耳后附近，若面神经受到血管压迫等刺激，也可能引发耳后局部的跳痛，这种情况可能会伴随面部其他区域的异样感觉。
二、耳部疾病相关
外耳道炎： 外耳道发炎时，炎症刺激可能会波及周围组织，包括耳后，从而引起耳后跳着疼。外耳道炎常伴有外耳道红肿、疼痛、分泌物增多等表现，一般是由于细菌感染等原因引起，比如游泳后耳朵进水未及时清理，就容易引发外耳道炎。中耳炎： 中耳发生炎症时，炎症可能会向周围扩散，累及耳后区域，导致耳后跳痛。中耳炎患者通常还会有耳部流脓、听力下降、耳鸣等症状，常见的是细菌感染引起的急性中耳炎，儿童相对更易患中耳炎。
三、其他因素
颈椎病： 颈椎病可能会压迫神经，当压迫到支配耳后区域的神经时，也可能出现耳后跳着疼的情况。长期不良的坐姿、颈部过度劳累等都可能诱发颈椎病，同时还可能伴有颈部疼痛、上肢麻木等症状。精神因素： 长期精神紧张、焦虑、压力过大等精神因素也可能导致神经功能紊乱，从而出现耳后跳着疼的情况。这种情况下，疼痛可能会随情绪变化而加重或减轻，一般没有明显的器质性病变基础。