怀孕39周肚子像来月经一样隐隐的疼可能有多种原因，包括假性宫缩、临产先兆、急性胃肠炎、泌尿系统感染等，应及时就医明确原因并遵医嘱处理，具体如下：
一、假性宫缩：在怀孕39周这一孕晚期阶段，可能会出现假性宫缩，从而导致肚子隐隐作痛，同时伴有肚子发紧、发硬的情况，但通常没有规律，在休息后可缓解。此时应密切关注胎动情况以及做好胎心监护，安心等待分娩即可。
二、临产先兆：怀孕39周时胎儿已成熟，耻骨会逐渐张开，这可能引起下腹隐痛以及耻骨痛，还可能伴有阴道流血以及出现规律性宫缩。若有这些表现，则考虑是临产先兆，需要及时就医并住院待产。
三、急性胃肠炎：若是进食了不卫生的食物，可能引发急性胃肠道炎症，进而导致肚子隐隐作痛以及出现腹泻等症状。如果是细菌感染，可给予头孢克洛、蒙脱石散、双歧杆菌等药物进行治疗。
四、泌尿系统感染：比如急性尿道炎、膀胱炎等，会引起肚子隐隐作痛，同时伴有尿频、尿急、排尿刺痛等症状。确诊后可给予头孢丙烯、头孢地尼等药物进行治疗。
总之，怀孕39周出现肚子隐痛时，要根据具体情况判断原因，以便采取恰当的应对措施。