冰硼散中含有朱砂等成分，其中的某些物质可能对溃疡面产生刺激，从而导致疼痛。
一、个体差异因素
不同人群的口腔黏膜敏感度不同，有些人的口腔黏膜较为娇嫩，对药物成分的刺激更为敏感，使用冰硼散时就更容易感觉到疼痛。比如，儿童的口腔黏膜比成人更脆弱，使用冰硼散时可能会比成人更痛。
二、溃疡严重程度因素
当口腔溃疡较为严重时，溃疡面破损程度较大，此时使用冰硼散，药物接触到深层的神经末梢，就会引发较强烈的疼痛感觉。例如，溃疡面较深、面积较大的患者使用冰硼散时可能痛感更明显。
三、药物使用方法因素
如果在使用冰硼散时没有正确的方法，比如涂抹药物时用力过大，或者涂抹的位置不准确，过度刺激溃疡面，也会加重疼痛。比如涂抹时过于粗暴，就会增加对溃疡处的刺激，导致疼痛加剧。
四、其他因素
若患者本身对冰硼散中的某些成分过敏，使用后也可能会因为过敏反应伴随疼痛等不适症状。另外，一些有特殊生活方式的人，如长期吸烟、饮酒的人，其口腔环境特殊，使用冰硼散时也可能感觉疼痛更明显。