胃肠感冒通常可以使用对症治疗的药物，一般来说，缓解症状的药物能起到较好效果。比如缓解发热、头痛等症状可选用对乙酰氨基酚等；缓解呕吐、腹泻等症状可使用蒙脱石散等。
对症缓解症状类药物
退热止痛药物：当胃肠感冒出现发热、头痛、身痛等症状时，常用对乙酰氨基酚。它能抑制前列腺素合成，从而发挥解热镇痛作用。不过，严重肝肾功能不全者禁用。止泻药物：如果胃肠感冒伴有腹泻症状，蒙脱石散较为常用。它可以在肠道内形成保护膜，吸附病原体和毒素，起到止泻作用。但过量服用可能引起便秘，老年人用药时需注意。
调节胃肠道功能类药物
益生菌类药物：像双歧杆菌四联活菌片就属于这类药物。它能补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，有助于改善胃肠感冒引起的胃肠功能紊乱。不过，应避免与抗菌药物同时服用，如需服用，两者服用时间需间隔2 - 3小时。促胃肠动力药物：多潘立酮可用于胃肠感冒伴有腹胀、恶心等症状的情况。它能促进胃肠蠕动，加快胃排空。但存在心律失常、机械性肠梗阻等情况的患者禁用。
抗病毒类药物
中成药：某些中成药也可用于胃肠感冒的治疗，比如藿香正气软胶囊。它具有解表化湿、理气和中的作用，对于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的胃肠感冒有一定疗效。但服用期间忌烟、酒及辛辣、生冷、油腻食物。西药抗病毒药：如果是由病毒感染引起的胃肠感冒，在发病初期，对于免疫力正常的成人，可考虑使用利巴韦林等抗病毒药物，但需在医生严格评估后使用，儿童使用需更加谨慎，因为利巴韦林可能有一定的副作用。