月经完后第三天同房，一般来说怀孕的概率相对较低，但也不是绝对安全。女性的月经周期若比较规律，排卵日通常在下次月经前14天左右，排卵日的前5天和后4天连同排卵日在内共10天称为排卵期，而月经完后第三天通常处于相对安全期，但也有少数女性月经周期不规律，可能会有额外排卵的情况，所以不能完全排除怀孕可能。
怀孕风险情况
规律周期女性：对于月经周期为28-30天左右比较规律的女性，月经完后第三天处于相对安全期，此时卵泡还未发育成熟，排卵概率较低，所以怀孕几率相对小。但如果月经周期较短，比如21天左右，那这个时间就可能接近排卵期，怀孕风险会增加。不规律周期女性：有些女性月经周期不固定，可能会提前或推后，那么就很难准确判断排卵期，月经完后第三天也有可能已经接近排卵时间，这时候同房就有怀孕的可能。
感染风险方面
细菌感染可能：同房过程中，即使处于相对安全期，也可能会带入细菌等病原体。女性阴道在月经刚结束后，抵抗力相对较弱，容易受到细菌侵袭，从而引发阴道炎等妇科炎症。比如常见的细菌性阴道炎，就可能在这种情况下发生，出现阴道分泌物增多、有异味、瘙痒等症状。交叉感染隐患：男性生殖器携带的病菌也可能传染给女性，导致女性生殖系统感染。如果男性本身有尿道炎等疾病，同房时就可能把病菌传染给女性，引起女性泌尿系统或生殖系统的感染问题。
其他注意事项
卫生清洁要点：同房前后双方都应该注意清洁卫生，女性要清洗外阴，男性也要清洗生殖器，这样可以减少感染的几率。尤其是女性，月经刚结束，更要保持外阴清洁，降低感染风险。做好防护准备：如果没有怀孕计划，为了避免意外怀孕和减少感染风险，最好采取合适的避孕措施，比如使用避孕套等。避孕套不仅可以避孕，还能在一定程度上阻挡病菌，起到预防感染的作用。