治疗抑郁症的药物有多种，常见的包括选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRI）等。例如，帕罗西汀是常用的SSRI类药物，它能通过抑制突触前膜对5-羟色胺的再摄取，增加突触间隙5-羟色胺浓度来发挥抗抑郁作用。
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂类
氟西汀：属于SSRI，可改善抑郁情绪，一般需要连续服用几周后才能逐渐发挥较好效果，对伴有焦虑的抑郁症有一定疗效。舍曲林：也是SSRI类药物，适用于各类抑郁症，对强迫症也有一定治疗作用，副作用相对较轻微，耐受性较好。
5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂类
文拉法辛：能同时抑制5-羟色胺和去甲肾上腺素的再摄取，对于中重度抑郁症有较好疗效，可缓解抑郁情绪、改善睡眠等症状，但初始用药时可能会有血压轻度升高的情况，需监测血压。度洛西汀：同样属于5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂，不仅能治疗抑郁症，还对慢性疼痛如糖尿病周围神经痛等有一定缓解作用，不过肝功能不全者需要谨慎使用。
去甲肾上腺素和特异性5-羟色胺能抗抑郁药类
米氮平：能阻断中枢突触前膜α2自受体及异受体，增强去甲肾上腺素能及5-羟色胺能神经传导，改善抑郁情绪的同时，还可能改善睡眠，对伴有睡眠障碍的抑郁症患者较为适用，但可能会引起体重增加等副作用。米安色林：也是该类药物，可通过调节5-羟色胺等神经递质来发挥抗抑郁作用，能改善患者的抑郁状态，不过有引起粒细胞减少的风险，用药期间需定期检查血常规。