扁桃体发炎主要是由病原体感染引起的，其中最常见的病原体是A组乙型溶血性链球菌，约占扁桃体炎病原体的10%~30%。此外，病毒也是引发扁桃体发炎的重要原因，像鼻病毒、腺病毒等病毒感染都可能导致扁桃体发炎。
病原体感染因素
细菌感染： A组乙型溶血性链球菌是引发扁桃体细菌感染性发炎的常见病菌。这种细菌常寄生在人的鼻咽部，当人体抵抗力下降时，它就会大量繁殖，侵袭扁桃体，引发炎症反应。比如在受凉、劳累等情况下，人体免疫力降低，细菌容易趁虚而入。病毒感染： 鼻病毒感染是导致扁桃体发炎的常见病毒因素之一。鼻病毒可以通过飞沫传播，当人接触到被病毒污染的空气后，病毒会侵袭扁桃体，引起扁桃体的炎症。腺病毒也是常见的引发扁桃体发炎的病毒，它可以在人群中传播，儿童相对更容易受到腺病毒感染而出现扁桃体发炎的情况。
自身抵抗力因素
免疫力低下： 当人体的免疫力低下时，就更容易受到病原体的侵袭。例如，长期营养不良的人，身体的免疫功能会受到影响，扁桃体抵御病原体的能力下降，从而容易发生发炎。过度劳累的人，身体处于疲劳状态，免疫力也会降低，这时候也比较容易患上扁桃体发炎。年龄因素： 儿童时期扁桃体处于活跃的免疫状态，相对更容易发生发炎。因为儿童的免疫系统还在发育过程中，抵抗力相对较弱。而老年人随着年龄增长，免疫力逐渐下降，也容易出现扁桃体发炎的情况。比如3~10岁的儿童是扁桃体发炎的高发年龄段，这与他们免疫系统发育不完善有关。
环境因素影响
气候因素： 季节变化时，气温、湿度等气候条件的改变可能会诱发扁桃体发炎。比如在秋冬季节，气温较低，人体的呼吸道黏膜防御功能会受到一定影响，容易受到病原体侵袭，从而引发扁桃体发炎。再比如在寒冷干燥的环境中，空气湿度低，呼吸道黏膜容易干燥，抵抗力下降，也容易导致扁桃体发炎。生活环境因素： 长期处于空气污染严重的环境中，空气中的有害颗粒、化学物质等会刺激扁桃体，增加扁桃体发炎的风险。例如在工业污染严重的地区，或者长期处于二手烟环境中的人，扁桃体受到刺激的机会增多，更容易发生发炎。