子宫肌壁间肌瘤的发生原因目前尚未完全明确，可能与多种因素相关。一般认为，女性体内的雌激素水平异常是重要因素之一，据统计，育龄期女性相对更易患子宫肌壁间肌瘤，这与育龄期女性体内雌激素分泌相对活跃有关。
激素水平因素
雌激素的影响： 雌激素能促进子宫肌细胞的增生。当体内雌激素水平持续处于较高状态时，比如长期服用含雌激素的药物，或者一些疾病导致雌激素分泌过多，就可能刺激子宫肌壁间的平滑肌细胞增生，从而引发肌瘤。孕激素的作用： 孕激素也参与了肌瘤的形成过程。孕激素能促进肌瘤细胞的分裂增殖，若孕激素水平失衡，也会增加子宫肌壁间肌瘤的发生风险。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 有研究发现，子宫肌壁间肌瘤具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有子宫肌壁间肌瘤，那么其他女性成员患该病的风险可能会相对增高。比如，母亲患有子宫肌壁间肌瘤，其女儿患该病的几率比无家族史的女性要高一些。基因层面的关联： 某些特定的基因变异可能与子宫肌壁间肌瘤的发生相关。虽然具体的基因机制还在进一步研究中，但已经发现一些基因的异常改变与肌瘤的形成有联系。
干细胞突变因素
平滑肌干细胞突变： 子宫肌壁间的平滑肌干细胞如果发生突变，可能会导致其异常增殖，进而形成肌瘤。这种干细胞的突变可能是在一些内外因素的作用下发生的，比如长期的炎症刺激、不良的生活习惯等都可能诱发干细胞突变，从而增加子宫肌壁间肌瘤的发病几率。